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DNAnexus

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一家专注于基因组数据分析和管理的美国云计算公司。

最近更新 2026年8月31日

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概览

DNAnexus是一家美国基因组技术公司,提供基于云的DNA序列数据存储、管理、分析和共享基础设施。公司成立于2009年,是斯坦福大学的一个衍生公司,旨在应对下一代DNA测序带来的计算和数据管理需求。其平台结合了云存储、可扩展计算、生物信息学应用、工作流执行和协作工具,使研究组织和临床实验室无需内部构建所有必要基础设施即可处理大型基因组数据集。 公司最初的技术专为DNA序列分析设计,支持常见的生物信息学任务,如读段比对、RNA测序分析、ChIP-seq处理和基因组变异分析。其基础设施使用亚马逊网络服务进行计算和存储。平台模式允许用户将测序数据带入托管环境,运行分析应用和流程,保存中间和最终结果,并与协作者共享数据或工作流。这一定位使DNAnexus介于传统实验室信息学系统、生物信息学软件供应商和通用公共云提供商之间。 DNAnexus通过涉及学术研究组织和测序联盟的项目与大规模基因组计算联系在一起。2013年,它与贝勒医学院人类基因组测序中心合作,为CHARGE联盟进行了涉及数千个全人类基因组和外显子组的云分析。该项目展示了使用公共云基础设施处理涉及数百TB基因组数据和数百万核心小时计算的工作负载。 公司还涉足公共数据和临床应用。2011年,在国家生物技术信息中心序列读段档案未来资金不确定后,DNAnexus与谷歌合作创建了云托管镜像和访问档案的新界面。该托管工作于2012年结束,因为NCBI表示将继续资助该数据库,尽管DNAnexus继续为NCBI托管的资源提供搜索和浏览界面。2012年,公司宣布与Geisinger健康系统和加州大学旧金山分校合作,将其技术应用于临床医学。2013年,它开始向临床检测实验室提供平台服务,将目标市场扩展到学术基因组学之外。 DNAnexus还寻求围绕其平台构建应用生态系统。2013年推出的开发者计划旨在帮助软件开发人员创建可在DNAnexus环境中运行的应用。公司通过风险投资为其扩张提供资金,包括来自First Round Capital、K9 Ventures和SoftTech VC的早期资金,2011年宣布的1500万美元融资,以及2014年宣布的额外1500万美元C轮融资。其公众形象集中在基因组数据基础设施上,而非消费者基因检测、测序仪器或制药产品。

沿革

DNAnexus于2009年初成立,是斯坦福大学的衍生公司。其创始人是斯坦福大学教授Serafim Batzoglou和Arend Sidow,以及斯坦福计算机科学家Andreas Sundquist。创立的前提是DNA测序的快速采用正在造成计算、存储、可重复性和协作方面的瓶颈。DNAnexus不是要求每个研究小组组装自己的服务器和软件环境,而是寻求为基因组数据提供托管云平台。 公司从First Round Capital、K9 Ventures和SoftTech VC获得了155万美元的早期风险融资。2010年4月,它推出了基于云的序列数据服务。该服务旨在支持存储和计算分析,使用公共云资源根据项目规模扩展工作负载。其应用包括读段比对、RNA-seq、ChIP-seq和基因组变异分析。亚马逊网络服务作为重要工作负载的基础设施。 2011年,DNAnexus通过招聘计划和融资吸引了更多关注。它在10月宣布了一轮1500万美元的融资,参与者包括谷歌风投、TPG生物技术、First Round Capital、SoftTech VC、K9 Ventures和Felicis Ventures。大约在同一时期,它回应了NCBI序列读段档案可能失去资金的担忧。DNAnexus与谷歌云存储合作,开发了档案的镜像和新网络界面。托管副本包含超过350TB的序列数据。NCBI后来确认继续支持该档案,DNAnexus于2012年6月停止托管镜像,同时继续为NCBI托管的数据库提供搜索和浏览功能。 公司在2012年扩大了其临床和转化雄心。它宣布与Geisinger健康系统和加州大学旧金山分校合作,将其技术适应于临床医学。2013年,它将其平台作为服务提供给临床检测实验室。这一举措反映了从主要作为研究基础设施向支持受监管或临床导向的基因组工作流的转变,尽管现有参考资料并未确定公司后来监管产品的完整范围。 DNAnexus还投资于平台可扩展性。2013年6月,它推出了一个开发者计划,旨在帮助第三方构建可在平台上运行的应用。该方法旨在使公司的环境不仅作为托管分析服务有用,而且作为专业生物信息学工具和工作流的基础。 平台可扩展性的一个主要展示是在2013年10月,DNAnexus宣布与贝勒医学院人类基因组测序中心合作。合作伙伴为基因组流行病学心脏和衰老研究队列联盟分析了3,751个全人类基因组和10,771个外显子组。该工作使用了亚马逊网络服务,约240万核心小时,并产生了约430TB的数据。它被呈现为当时完成的最大规模云基因组分析。 2014年1月,DNAnexus宣布了一轮1500万美元的C轮融资,涉及Claremont Creek Ventures、First Round Capital、谷歌风投和TPG生物技术。该融资支持了公司作为基因组数据平台的持续发展。提供的参考资料中公开记录的材料对后来的公司事件、所有权、当前领导层、收入或财务业绩提供了有限的细节。公司记录的身份仍然是面向研究和临床用户的基于云的基因组数据分析和管理的提供商。

  • 2014

    宣布C轮融资

    [1]

    DNAnexus宣布了一轮1500万美元的C轮融资,由现有和新风险投资者领投。

  • 2013

    临床实验室服务推出

    [1]

    公司开始向临床检测实验室提供其平台作为服务。

  • 2013

    完成贝勒大规模基因组分析

    [1]

    DNAnexus和贝勒报告了为CHARGE联盟进行的数千个基因组和外显子组的云分析。

  • 2012

    宣布临床医学合作

    [1]

    DNAnexus宣布与Geisinger健康系统和加州大学旧金山分校合作,将其平台适应于临床应用。

  • 2011

    宣布重大风险融资

    [1]

    公司宣布了一轮来自技术和生物技术投资者群体的1500万美元融资。

  • 2011

    序列读段档案镜像项目宣布

    [1]

    DNAnexus与谷歌合作,为NCBI的序列读段档案开发云托管镜像和界面。

  • 2010

    云序列数据服务推出

    [1]

    DNAnexus于4月推出了其基于云的基因组序列数据服务。

  • 2009

    公司成立为斯坦福衍生公司

    [1]

    DNAnexus由斯坦福附属研究人员和计算机科学家创立,以解决大规模DNA序列分析的基础设施需求。

产品与定位

面向研究组织、测序项目和临床实验室的基于云的基因组数据和生物信息学平台。

  • 基因组云平台 · 2010

    DNAnexus平台

    DNAnexus平台是公司用于基因组数据存储、管理、分析、工作流执行和协作的核心云环境。它旨在让研究人员和临床实验室使用可扩展的云基础设施运行计算密集型测序工作流,而无需维护等效的本地系统。记录的功能包括读段比对、RNA-seq、ChIP-seq和基因组变异分析的应用,以及处理大型数据集和共享结果的工具。

  • 基因组数据发现 · 2011

    序列读段档案搜索和浏览界面

    DNAnexus开发了一个网络界面,用于搜索和浏览与国家生物技术信息中心序列读段档案相关的序列数据。当档案的未来资金不确定时,公司还与谷歌合作开发了一个大型云托管镜像。在NCBI继续资助档案且DNAnexus结束镜像托管工作后,该界面仍然是公司对公共资源访问和发现贡献的一部分。

  • 临床实验室信息学 · 2013

    临床基因组学平台服务

    从2013年开始,DNAnexus向临床检测实验室提供其云平台作为服务。该服务将公司面向研究的基因组分析能力扩展到临床实验室环境,其中序列数据必须作为测试工作流的一部分进行处理、解释、存储和共享。提供的参考资料未指定该产品的完整名称或该产品后来的监管状态。

营销活动

  • 2013开发者计划

    International

    DNAnexus推出了一项计划,帮助软件开发人员创建可在其基因组学平台上运行的应用,支持围绕云生物信息学的生态系统方法。

    结果. 提供的参考资料确认了该计划的启动,但未记录参与水平或后续商业成果。

品牌决策

  • 2013

    将平台扩展到临床检测实验室战略

    背景

    在与Geisinger健康系统和加州大学旧金山分校合作开展临床应用后,DNAnexus寻求将其技术扩展到学术研究之外。

    采取的行动

    公司开始向临床检测实验室提供其基于云的平台作为DNA序列分析的服务。

    后续影响

    这扩大了记录的目标市场,包括临床基因组学和实验室信息学用户。

  • 2012

    终止托管序列读段档案镜像战略

    背景

    DNAnexus曾与谷歌合作托管NCBI序列读段档案的镜像,因为担心NCBI资金可能中断。

    采取的行动

    在NCBI宣布将继续资助该档案后,DNAnexus停止托管镜像数据集,并继续提供搜索和浏览界面。

    后续影响

    该决定使公司的角色与NCBI托管的档案保持一致,同时保留了面向用户的发现功能。

近期事件

  • 报道

    DNAnexus 完成 2 亿美元融资[3]

    DNAnexus 表示已完成 2 亿美元融资,资金将用于推动其技术的全球应用。Blackstone Growth 管理的基金领投,现有投资者参与。

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来源3 个来源

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