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InChI信托

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一家英国非营利组织,负责开发、维护和推广国际化学标识符标准。

最近更新 2026年8月25日

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概览

InChI信托是一家英国非营利组织,负责支持国际化学标识符(通常缩写为InChI,发音为“IN-chee”)的开发、维护和采用。InChI是一种开放、非专有的文本表示法,用于从分子结构数据表示化学物质。该组织与其说是一个传统的消费或工业品牌,不如说是一个标准管理者和技术社区机构,服务于化学数据库、化学信息学软件、研究组织、出版商以及其他使用机器可读化学信息的用户。 InChI项目起源于国际纯粹与应用化学联合会(IUPAC)和美国国家标准与技术研究院(NIST)在2000年至2005年间的工作。该软件和标识符的首次公开发布出现在2005年。其设计旨在提供一种从结构派生的标识符,能够支持跨数据库和网络的化学信息搜索、索引和链接,而无需中央机构分配注册号。与CAS注册号等专有或机构分配的标识符不同,InChI可以使用公开可用的算法从化学结构生成,并旨在自由使用。 InChI通过分层信息对物质进行编码。根据所选形式,这些层可以描述分子式、原子连接性、氢位置、电荷和质子化、立体化学、同位素组成、互变异构信息以及某些与金属相关的连接性约定。该算法通过归一化、规范化和序列化处理输入结构。归一化将替代表示简化为共同的化学解释;规范化分配可重现的编号方案;序列化将结果写为结构化的文本字符串。这种架构允许在不同软件和数据库之间比较具有化学意义的组件,尽管该标准不表示三维原子坐标。 一个主要的关联产品是InChIKey,一种固定长度的哈希表示,专为实际网络搜索设计。完整的InChI字符串可能很长,难以用作搜索词,而InChIKey紧凑且具有一致的27字符形式,分为多个部分。由于哈希不可逆,InChIKey必须通过数据库或解析器服务与底层InChI关联。因此,InChI生态系统支持标识符生成和化学信息服务之间的互操作性。 InChI信托还支持扩展和相关技术格式,包括反应InChI(RInChI),它通过反应物、产物和试剂的InChI字符串组表示化学反应。更广泛的软件生态系统包括分子编辑器、数据库管道、网络服务、独立可执行文件以及针对Linux等操作系统的打包实现。这些用途使InChI成为基础互操作性层,而非最终用户产品品牌。 自2009年5月以来,InChI信托一直作为非营利机构,负责该标准的开发和推广。其工作包括协调技术改进、支持软件发布、鼓励化学信息工具的实施以及保持版本间的一致性。根据引用的参考资料,2024年8月发布的1.07.1版本将软件移至MIT许可证。这一许可变更进一步强调了项目的开放性和广泛可重用性。因此,该组织目前的作用主要集中在维护一个持久、社区导向的化学标识符标准,而不是销售化学产品或运营传统的商业组合。

沿革

InChI信托源于国际化学标识符的开发,该项目由IUPAC和NIST于2000年发起。该项目解决了化学信息管理中的一个长期问题:化学物质可以通过系统名称、注册号、线性表示法、图形、数据库记录和其他格式表示,但这些表示并不总是提供一种共同的、可自由计算的键来跨系统链接记录。该项目的目标是创建一种从分子结构派生的文本标识符,能够支持数据库索引和网络搜索,同时保持非专有性。 开发持续到2000年代上半叶,首个InChI版本于2005年发布。该标识符被设计为分层表示而非简单名称。其主层记录归一化结构的分子式和连接性,而附加层可以编码电荷、质子化、立体化学、同位素信息和其他结构差异。归一化过程很重要,因为不同的图形或输入约定否则可能产生不一致的结果。特别是,标准处理可以将替代的互变异构或质子化表示简化为共同的母体解释。 该项目还创建了基于软件的规范化方法。归一化后,原子被分配可重现的编号,所得信息被序列化为定义的字符串格式。这使得独立的软件实现能够从相同的结构输入生成可比较的标识符。InChI在某些方面比简单的线性表示法更具结构表现力,尽管它不打算编码三维坐标。 完整标识符的一个实际限制是其长度。为了支持搜索引擎和网络服务,InChIKey规范于2007年9月发布。InChIKey是InChI的紧凑哈希形式。它作为搜索和索引令牌很有用,但不能重建原始标识符,并且不能数学上保证无冲突。因此,需要解析器服务和化学数据库将键与完整的InChI字符串和分子记录关联。 2009年1月发布的1.02版本引入了标准InChI。这固定了标准形式使用的结构细节和约定水平,帮助不同数据库和软件系统更一致地比较标识符。2009年5月,InChI信托成为支持该标准持续开发和推广的非营利组织。其角色包括维护软件、协调技术工作、鼓励实施以及代表该标识符作为化学信息社区开放基础设施项目。 InChI家族随后扩展到单个物质之外。反应InChI(RInChI)将底层方法应用于化学反应,通过组织反应物、产物和试剂的标识符。与InChI一起生成的辅助信息可以保留原子映射、等价关系以及用于重现或重绘输入结构的数据。这些能力支持了与分子编辑器、数据库、解析器和研究软件的集成。 项目的分发模式仍然是其身份的核心。InChI被创建为非专有标准,可以从结构信息生成,而不是由单一注册组织分配。根据引用的参考资料,2024年8月发布的1.07.1版本使用MIT许可证。这为持续采用和实施提供了宽松的法律基础。因此,InChI信托的历史主要是技术标准化、开放软件管理和化学数据互操作性的历史,而不是商业品牌扩张。

  • 2024

    InChI 1.07.1版本采用MIT许可

    [1]

    2024年8月的软件版本使用MIT许可证。

  • 2009

    标准InChI推出

    [1]

    1.02版本提供了固定细节的标准InChI和相应的标准InChIKey约定。

  • 2009

    InChI信托接管管理

    [1]

    自2009年5月起,英国非营利组织InChI信托支持该标准的开发和推广。

  • 2007

    InChIKey规范发布

    [1]

    引入一种紧凑的哈希标识符,使化学结构搜索在网络中更实用。

  • 2005

    首个InChI版本发布

    [1]

    国际化学标识符的首个公开版本发布。

  • 2000

    InChI项目启动

    [1]

    IUPAC和NIST开始开发一种机器可读、非专有的化学物质标识符。

产品与定位

化学结构识别和化学信息学互操作性的开放标准管理者。

  • 化学结构标识符 · 2005

    国际化学标识符(InChI)

    InChI是从结构信息生成的化学物质的文本表示。其分层格式可以编码分子式、连接性、氢位置、电荷、质子化、立体化学、同位素以及选定的互变异构或金属连接性信息。该算法对输入进行归一化,分配规范的原子排序,并将结果序列化。它专为数据库索引、记录链接和基于网络的化学搜索而设计。

  • 哈希化学标识符 · 2007

    InChIKey

    InChIKey是InChI的固定长度、27字符的哈希派生表示。它旨在比完整的InChI字符串更容易搜索、存储和交换。该键不可逆,并且存在很小的理论碰撞可能性,因此必须通过解析器或数据库与完整的InChI或化学记录关联。

  • 标准化化学标识符 · 2009

    标准InChI

    标准InChI是InChI的一种受限形式,使用固定约定和定义的结构细节水平。通过减少标识符生成方式的差异,它帮助数据库和独立软件系统更可靠地比较化学记录。其对应的哈希形式是标准InChIKey。

  • 反应标识符

    反应InChI(RInChI)

    RInChI将InChI方法扩展到化学反应。它组织反应物、产物和试剂的InChI字符串,并添加区分其角色所需的反应级信息。该格式旨在改善跨化学信息学系统的反应数据的机器可读交换和链接。

  • 化学信息学软件 · 2005

    InChI软件和辅助信息

    InChI软件生成标识符,并可产生描述原子映射、等价关系以及用于重建或重绘输入结构的数据的辅助信息。实现可通过化学编辑器、独立可执行文件、网络服务和操作系统包获得。

品牌决策

  • 2024

    为InChI软件采用MIT许可证战略

    背景

    该项目继续强调其化学识别软件的广泛重用和开放实施。

    采取的行动

    2024年8月发布的1.07.1版本使用了MIT许可证。

    后续影响

    该版本为将软件纳入化学信息工具的用户和开发者提供了宽松的许可框架。

  • 2009

    创建非营利管理组织战略

    背景

    InChI项目在IUPAC和NIST初步开发后需要持续的技术维护和推广。

    采取的行动

    自2009年5月起,InChI信托开始作为支持该标准开发和采用的非营利组织。

    后续影响

    该信托成为InChI软件和相关标准工作的主要机构管理者。

来源2 个来源

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